Heizen Sie den Backofen auf 180∘C Ober-/Unterhitze vor.
Erhitzen Sie das Olivenöl in einer Pfanne. Dünsten Sie die gewürfelte Zwiebel darin bei mittlerer Hitze glasig (ca. 3 Minuten).
Fügen Sie die Paprikawürfel hinzu und braten Sie sie 2–3 Minuten mit.
Geben Sie den gehackten Spinat hinzu und lassen Sie ihn kurz zusammenfallen. Nehmen Sie die Pfanne vom Herd.
Verquirlen Sie die Eier, Milch (falls verwendet), Salz, Pfeffer und Muskatnuss in einer großen Schüssel. Schlagen Sie die Masse so lange, bis sie leicht schaumig ist.
Fetten Sie ein Standard-Muffinblech mit 12 Mulden gut ein oder verwenden Sie Papier-Muffin-Förmchen.
Verteilen Sie die vorbereitete Gemüse-Mischung gleichmäßig auf die 12 Mulden.
Verteilen Sie die Feta- oder Käsewürfel ebenfalls auf die Mulden.
Gießen Sie die Eimasse gleichmäßig über das Gemüse und den Käse, bis die Mulden zu etwa dreiviertel gefüllt sind.
Backen Sie die Eier-Muffins für ca. 18–22 Minuten im vorgeheizten Ofen, bis die Mitte der Muffins fest ist und sie leicht goldbraun sind.
Lassen Sie die Eier-Muffins nach dem Backen kurz im Blech abkühlen und lösen Sie sie dann vorsichtig heraus.
Lassen Sie sie vollständig auf einem Gitterrost abkühlen, bevor Sie sie in luftdichte Behälter füllen.
Haltbarkeit: Im Kühlschrank halten sich die Eier-Muffins ca. 4 Tage. Sie können kalt oder kurz in der Mikrowelle oder im Ofen aufgewärmt gegessen werden.